Тайваньская наёмница по прозвищу Стеклянное Сердце решает свести счёты с жизнью, бросившись с высотного здания. Но судьба распоряжается иначе — вместо мгновенной смерти она оказывается на острых прутьях ограды, получая тяжёлые повреждения сердца. Чудом выжив после пересадки донорского органа, девушка погружается в череду загадочных видений, которые ведут её в Японию. Там она начинает поиски женщины по имени Каори Макимура, чьё сердце теперь бьётся в её груди.
После пробуждения от комы героиня осознаёт, что пережитые ею сны — не просто галлюцинации. Они связаны с личностью донора, которая, как выясняется, была близка легендарному Городскому Охотнику. Хотя мир «Сердца ангела» населён знакомыми персонажами из классического манга-сериала, сюжет развивается в совершенно иной реальности. Здесь нет прямой связи с оригинальной историей, лишь отголоски прошлого, переплетающиеся с новой судьбой главной героини.
Путь Стеклянного Сердца превращается в мистическое путешествие, где каждая встреча приоткрывает тайны её нового сердца. Вопреки ожиданиям, пересадка органа принесла не только физическое исцеление, но и фрагменты чужой памяти, необъяснимую тягу к незнакомым местам и людям. Теперь её жизнь — это поиск ответов среди теней прошлого, где правда о Каори может изменить всё. Но сможет ли она отделить свои желания от тех, что диктует ей чужое сердце?